Akàn pancreatic jẹ ọkan ninu awọn èèmọ iku julọ ni agbaye pẹlu asọtẹlẹ ti ko dara.Nitorinaa, awoṣe asọtẹlẹ deede ni a nilo lati ṣe idanimọ awọn alaisan ti o ni eewu giga ti akàn pancreatic lati ṣe deede itọju ati ilọsiwaju asọtẹlẹ ti awọn alaisan wọnyi.
A gba The akàn Genome Atlas (TCGA) pancreatic adenocarcinoma (PAAD) data RNAseq lati ibi ipamọ data UCSC Xena, ṣe idanimọ awọn lncRNAs ti o ni ibatan ajẹsara (irlncRNAs) nipasẹ itupalẹ ibamu, ati ṣe idanimọ awọn iyatọ laarin TCGA ati awọn ara adenocarcinoma pancreatic deede.DEirlncRNA) lati TCGA ati ikosile genotype tissu (GTEx) ti àsopọ pancreatic.Siwaju univariate ati awọn itupale ipadasẹhin lasso ni a ṣe lati kọ awọn awoṣe ibuwọlu asọtẹlẹ.Lẹhinna a ṣe iṣiro agbegbe labẹ ọna ti tẹ ati pinnu iye gige gige ti o dara julọ fun idamo awọn alaisan ti o ni adenocarcinoma pancreatic ti o ga ati eewu kekere.Lati ṣe afiwe awọn abuda ile-iwosan, ifasilẹ sẹẹli ajẹsara, microenvironment ajẹsara, ati resistance chemotherapy ni awọn alaisan ti o ni akàn pancreatic ti o ga- ati ewu kekere.
A ṣe idanimọ awọn orisii 20 DEirlncRNA ati awọn alaisan akojọpọ ni ibamu si iye gige ti o dara julọ.A ṣe afihan pe awoṣe ibuwọlu asọtẹlẹ wa ni iṣẹ ṣiṣe pataki ni asọtẹlẹ asọtẹlẹ ti awọn alaisan pẹlu PAAD.AUC ti iyipo ROC jẹ 0.905 fun asọtẹlẹ ọdun 1, 0.942 fun asọtẹlẹ ọdun 2, ati 0.966 fun asọtẹlẹ ọdun 3.Awọn alaisan ti o ni eewu giga ni awọn oṣuwọn iwalaaye kekere ati awọn abuda ile-iwosan ti o buruju.A tun ṣe afihan pe awọn alaisan ti o ni eewu giga jẹ ajẹsara ati pe o le dagbasoke resistance si imunotherapy.Ayẹwo ti awọn oogun akàn gẹgẹbi paclitaxel, sorafenib, ati erlotinib ti o da lori awọn irinṣẹ asọtẹlẹ iṣiro le jẹ deede fun awọn alaisan ti o ni ewu ti o ga julọ pẹlu PAAD.
Lapapọ, iwadi wa ṣe agbekalẹ awoṣe eewu asọtẹlẹ tuntun ti o da lori isodipọ irlncRNA, eyiti o ṣe afihan iye asọtẹlẹ ti o ni ileri ninu awọn alaisan ti o ni akàn pancreatic.Awoṣe eewu asọtẹlẹ wa le ṣe iranlọwọ ṣe iyatọ awọn alaisan pẹlu PAAD ti o dara fun itọju iṣoogun.
Akàn pancreatic jẹ tumo buburu pẹlu iwọn iwalaaye ọdun marun kekere ati ipele giga.Ni akoko ayẹwo, ọpọlọpọ awọn alaisan ti wa ni awọn ipele to ti ni ilọsiwaju.Ni aaye ti ajakale-arun COVID-19, awọn dokita ati nọọsi wa labẹ titẹ nla nigbati wọn nṣe itọju awọn alaisan ti o ni akàn pancreatic, ati pe awọn idile awọn alaisan tun dojuko awọn igara pupọ nigbati wọn ba ṣe awọn ipinnu itọju [1, 2].Botilẹjẹpe a ti ṣe awọn ilọsiwaju nla ni itọju awọn DOADs, gẹgẹbi itọju ailera neoadjuvant, isọdọtun abẹ-abẹ, itọju itanjẹ, chemotherapy, itọju molikula ti a fojusi, ati awọn inhibitors checkpoint (ICIs), nikan nipa 9% ti awọn alaisan ye ọdun marun lẹhin ayẹwo [3] ].], 4].Nitoripe awọn aami aiṣan akọkọ ti adenocarcinoma pancreatic jẹ aṣoju, awọn alaisan maa n ṣe ayẹwo pẹlu awọn metastases ni ipele to ti ni ilọsiwaju [5].Nitorinaa, fun alaisan ti a fun, itọju okeerẹ ẹni kọọkan gbọdọ ṣe iwọn awọn anfani ati aila-nfani ti gbogbo awọn aṣayan itọju, kii ṣe lati pẹ iwalaaye nikan, ṣugbọn lati mu didara igbesi aye dara si [6].Nitorinaa, awoṣe asọtẹlẹ ti o munadoko jẹ pataki lati ṣe ayẹwo deede asọtẹlẹ alaisan [7].Nitorinaa, itọju ti o yẹ ni a le yan lati dọgbadọgba iwalaaye ati didara igbesi aye awọn alaisan pẹlu PAAD.
Asọtẹlẹ ti ko dara ti PAAD jẹ pataki nitori atako si awọn oogun chemotherapy.Ni awọn ọdun aipẹ, awọn inhibitors checkpoint ajẹsara ti jẹ lilo pupọ ni itọju awọn èèmọ to lagbara [8].Sibẹsibẹ, lilo awọn ICI ni akàn pancreatic jẹ ṣọwọn aṣeyọri [9].Nitorina, o ṣe pataki lati ṣe idanimọ awọn alaisan ti o le ni anfani lati itọju ailera ICI.
RNA ti kii ṣe ifaminsi gigun (lncRNA) jẹ iru ti kii ṣe ifaminsi RNA pẹlu awọn iwe afọwọkọ> 200 nucleotides.Awọn LncRNA wa ni ibigbogbo ati pe o jẹ nipa 80% ti kikọsilẹ eniyan [10].Ara iṣẹ nla ti fihan pe awọn awoṣe asọtẹlẹ orisun-lncRNA le ṣe asọtẹlẹ asọtẹlẹ alaisan daradara [11, 12].Fun apẹẹrẹ, awọn lncRNA ti o ni ibatan autophagy 18 ni a ṣe idanimọ lati ṣe agbekalẹ awọn ibuwọlu asọtẹlẹ ni alakan igbaya [13].Awọn lncRNA ti o ni ibatan ajẹsara mẹfa miiran ni a ti lo lati fi idi awọn ẹya asọtẹlẹ ti glioma [14].
Ninu akàn pancreatic, diẹ ninu awọn ijinlẹ ti ṣe agbekalẹ awọn ibuwọlu orisun lncRNA lati ṣe asọtẹlẹ asọtẹlẹ alaisan.Ibuwọlu 3-lncRNA jẹ idasilẹ ni adenocarcinoma pancreatic pẹlu agbegbe labẹ ọna ROC (AUC) ti 0.742 nikan ati iwalaaye gbogbogbo (OS) ti ọdun 3 [15].Ni afikun, awọn iye ikosile lncRNA yatọ laarin awọn genomes oriṣiriṣi, awọn ọna kika data oriṣiriṣi, ati awọn alaisan oriṣiriṣi, ati iṣẹ ti awoṣe asọtẹlẹ jẹ riru.Nitorinaa, a lo algoridimu awoṣe aramada, sisopọ ati aṣetunṣe, lati ṣe agbekalẹ awọn ibuwọlu lncRNA (irlncRNA) ti o ni ibatan ajesara lati ṣẹda deede ati awoṣe asọtẹlẹ iduroṣinṣin [8].
Awọn data RNAseq ti a ṣe deede (FPKM) ati akàn pancreatic TCGA ati awọn alaye genotype tissue (GTEx) ni a gba lati inu aaye data UCSC XENA (https://xenabrowser.net/datapages/).Awọn faili GTF ni a gba lati ibi ipamọ data Ensembl (http://asia.ensembl.org) ati pe a lo lati yọkuro awọn profaili ikosile lncRNA lati RNAseq.A ṣe igbasilẹ awọn jiini ti o ni ibatan ajesara lati ibi ipamọ data ImPort (http://www.immport.org) ati ṣe idanimọ awọn lncRNA ti o ni ibatan ajesara (irlncRNAs) ni lilo itupalẹ ibamu (p <0.001, r> 0.4).Idanimọ ti awọn irlncRNAs ti o yatọ (DEirlncRNAs) ti a sọ ni iyatọ nipasẹ lila irlncRNA ati awọn lncRNA ti a sọ ni iyatọ ti o gba lati inu data GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) ninu ẹgbẹ TCGA-PAAD (| logFC|> 1 ati FDR ) <0.05).
Ọna yii ti royin tẹlẹ [8].Ni pato, a ṣe X lati rọpo lncRNA A ati lncRNA B. Nigbati iye ikosile ti lncRNA A ba ga ju iye ikosile ti lncRNA B, X ti wa ni asọye bi 1, bibẹẹkọ X jẹ asọye bi 0. Nitorinaa, a le gba matrix kan ti 0 tabi – 1. Iwọn inaro ti matrix duro fun ayẹwo kọọkan, ati ipo petele duro fun bata DEirlncRNA kọọkan pẹlu iye kan ti 0 tabi 1.
Itupalẹ ipadasẹhin alailẹgbẹ ti o tẹle pẹlu ifasilẹyin Lasso ni a lo lati ṣe ayẹwo awọn orisii DEirlncRNA asọtẹlẹ.Atunwo ifasilẹ lasso ti a lo 10-agbo-agbelebu-afọwọsi-agbelebu tun ni awọn akoko 1000 (p <0.05), pẹlu 1000 ID stimuli fun ṣiṣe.Nigbati igbohunsafẹfẹ kọọkan ti bata DEirlncRNA kọja awọn akoko 100 ni awọn akoko 1000, awọn orisii DEirlncRNA ni a yan lati kọ awoṣe eewu asọtẹlẹ kan.Lẹhinna a lo ọna AUC lati wa iye gige gige ti o dara julọ fun tito lẹtọ awọn alaisan PAAD si awọn ẹgbẹ ti o ni eewu giga ati kekere.Iye AUC ti awoṣe kọọkan tun jẹ iṣiro ati ṣe igbero bi ohun ti tẹ.Ti o ba ti tẹ ba de aaye ti o ga julọ ti o nfihan iye AUC ti o pọju, ilana iṣiro naa duro ati pe awoṣe jẹ oludije to dara julọ.1-, 3- ati 5-odun ROC ti tẹ si dede won ti won ko.Awọn itupale isọdọtun alailẹgbẹ ati ọpọlọpọ ni a lo lati ṣe ayẹwo iṣẹ asọtẹlẹ ominira ti awoṣe eewu asọtẹlẹ.
Lo awọn irinṣẹ meje lati ṣe iwadi awọn oṣuwọn infilt cell ajẹsara, pẹlu XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS, ati CIBERSORT.Awọn data ifasilẹ sẹẹli ti ajẹsara jẹ igbasilẹ lati ibi ipamọ data TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3).Iyatọ ti o wa ninu akoonu ti awọn sẹẹli ti nwọle ti ajẹsara laarin awọn ẹgbẹ ti o ga ati ewu kekere ti awoṣe ti a ṣe ni a ṣe atupale nipa lilo idanwo ipo-ipo Wilcoxon, awọn abajade ti han ni iwọn onigun mẹrin.Iṣiro ibamu Spearman ni a ṣe lati ṣe itupalẹ ibatan laarin awọn iye Dimegilio eewu ati awọn sẹẹli infiltrating ajẹsara.Abajade olùsọdipúpọ ibamu jẹ afihan bi lollipop kan.Ipele pataki ti ṣeto ni p <0.05.Ilana naa ni a ṣe pẹlu lilo R package ggplot2.Lati ṣe ayẹwo ibatan laarin awoṣe ati awọn ipele ikosile jiini ti o ni nkan ṣe pẹlu oṣuwọn infilt cell ajẹsara, a ṣe package ggstatsplot ati iworan Idite fayolini.
Lati ṣe iṣiro awọn ilana itọju ile-iwosan fun akàn pancreatic, a ṣe iṣiro IC50 ti awọn oogun chemotherapy ti a lo nigbagbogbo ninu ẹgbẹ TCGA-PAAD.Awọn iyatọ ninu awọn ifọkansi inhibitory idaji (IC50) laarin awọn ẹgbẹ ti o ga ati kekere ni a ṣe afiwe pẹlu lilo idanwo ipo-ipo Wilcoxon, ati awọn abajade ti a fihan bi awọn apoti apoti ti a ṣe ni lilo pRrophetic ati ggplot2 ni R. Gbogbo awọn ọna ni ibamu pẹlu awọn ilana ati awọn ilana ti o yẹ.
Ṣiṣan iṣẹ ti iwadii wa ni afihan ni Nọmba 1. Lilo itupalẹ ibamu laarin awọn lncRNAs ati awọn jiini ti o ni ibatan ajesara, a yan 724 irlncRNAs pẹlu p <0.01 ati r> 0.4.Nigbamii ti a ṣe atupale awọn lncRNAs ti o yatọ ti GEPIA2 (Aworan 2A).Apapọ awọn irlncRNA 223 ni a fihan ni iyatọ laarin adenocarcinoma pancreatic ati àsopọ pancreatic deede (|logFC|> 1, FDR <0.05), ti a npè ni DEirlncRNAs.
Ikole ti awọn awoṣe ewu asọtẹlẹ.(A) Idite onina ti awọn lncRNA ti a fihan ni iyatọ.(B) Pipin awọn iyeida lasso fun awọn orisii 20 DEirlncRNA.(C) Iyatọ ti o ṣeeṣe apakan ti pinpin olùsọdipúpọ LASSO.(D) Idite igbo ti n ṣafihan itupalẹ ifẹhinti univariate ti awọn orisii 20 DEirlncRNA.
Nigbamii ti a ṣe matrix 0 tabi 1 nipasẹ sisopọ 223 DEirlncRNAs.Apapọ awọn orisii 13,687 DEirlncRNA ni a ṣe idanimọ.Lẹhin ti irẹwẹsi ati itupalẹ ipadasẹhin lasso, awọn orisii 20 DEirlncRNA ni idanwo nipari lati kọ awoṣe eewu asọtẹlẹ kan (Aworan 2B-D).Da lori awọn abajade ti Lasso ati itupalẹ ipadasẹhin pupọ, a ṣe iṣiro iṣiro eewu fun alaisan kọọkan ninu ẹgbẹ TCGA-PAAD (Table 1).Da lori awọn abajade ti itupalẹ ifaseyin lasso, a ṣe iṣiro Dimegilio ewu fun alaisan kọọkan ninu ẹgbẹ TCGA-PAAD.AUC ti iṣipopada ROC jẹ 0.905 fun asọtẹlẹ awoṣe eewu ọdun 1, 0.942 fun asọtẹlẹ ọdun 2, ati 0.966 fun asọtẹlẹ ọdun 3 (Nọmba 3A-B).A ṣeto iye gige gige ti o dara julọ ti 3.105, tito awọn alaisan ẹgbẹ TCGA-PAAD sinu awọn ẹgbẹ ti o ga- ati eewu kekere, ati gbero awọn abajade iwalaaye ati awọn ipinpinpin Dimegilio eewu fun alaisan kọọkan (Aworan 3C-E).Iwadii Kaplan-Meier fihan pe iwalaaye ti awọn alaisan PAAD ninu ẹgbẹ ti o ni eewu ti o kere ju ti awọn alaisan ti o wa ninu ẹgbẹ eewu kekere (p <0.001) (Figure 3F).
Wiwulo ti awọn awoṣe eewu asọtẹlẹ.(A) ROC ti awoṣe eewu asọtẹlẹ.(B) Awọn awoṣe eewu asọtẹlẹ ROC 1-, 2-, ati ọdun mẹta.(C) ROC ti awoṣe ewu asọtẹlẹ.Ṣe afihan aaye gige-pipa ti aipe.(DE) Pipin ipo iwalaaye (D) ati awọn ikun eewu (E).(F) Ayẹwo Kaplan-Meier ti awọn alaisan PAAD ni awọn ẹgbẹ giga- ati kekere-ewu.
A tun ṣe ayẹwo awọn iyatọ ninu awọn ikun eewu nipasẹ awọn abuda ile-iwosan.Idite rinhoho (Aworan 4A) ṣe afihan ibatan gbogbogbo laarin awọn abuda ile-iwosan ati awọn ikun eewu.Ni pataki, awọn alaisan agbalagba ni awọn ikun eewu ti o ga julọ (Aworan 4B).Ni afikun, awọn alaisan ti o ni ipele II ni awọn ikun eewu ti o ga julọ ju awọn alaisan ti o ni ipele I (Aworan 4C).Nipa ipele tumo ni awọn alaisan PAAD, awọn alaisan 3 ite ni awọn ikun eewu ti o ga julọ ju ite 1 ati awọn alaisan 2 (Nọmba 4D).A tun ṣe awọn itupale iṣipopada univariate ati multivariate ati ṣe afihan pe Dimegilio ewu (p <0.001) ati ọjọ-ori (p = 0.045) jẹ awọn ifosiwewe asọtẹlẹ ominira ni awọn alaisan pẹlu PAAD (Figure 5A-B).Iwọn ROC ṣe afihan pe Dimegilio eewu naa ga ju awọn abuda ile-iwosan miiran ni asọtẹlẹ 1-, 2-, ati iwalaaye ọdun 3 ti awọn alaisan pẹlu PAAD (Figure 5C-E).
Awọn abuda ile-iwosan ti awọn awoṣe eewu asọtẹlẹ.Histogram (A) fihan (B) ọjọ ori, (C) ipele tumo, (D) ipele tumo, Dimegilio ewu, ati abo ti awọn alaisan ni ẹgbẹ TCGA-PAAD.** p <0.01
Itupalẹ asọtẹlẹ ominira ti awọn awoṣe eewu asọtẹlẹ.(AB) Univariate (A) ati multivariate (B) awọn itupalẹ ifaseyin ti awọn awoṣe eewu asọtẹlẹ ati awọn abuda ile-iwosan.(CE) 1-, 2-, ati 3-ọdun ROC fun awọn awoṣe eewu asọtẹlẹ ati awọn abuda ile-iwosan
Nitorinaa, a ṣe ayẹwo ibatan laarin akoko ati awọn ikun eewu.A rii pe Dimegilio eewu ni awọn alaisan PAAD ni isọdọtun pẹlu awọn sẹẹli CD8 + T ati awọn sẹẹli NK (Nọmba 6A), ti n tọka iṣẹ ajẹsara ti tẹmọlẹ ninu ẹgbẹ eewu giga.A tun ṣe ayẹwo iyatọ ninu ifasilẹ sẹẹli ti ajẹsara laarin awọn ẹgbẹ giga- ati kekere ti o ni ewu ati pe a rii awọn abajade kanna (Nọmba 7).Ko si infiltration ti awọn sẹẹli CD8+ T ati awọn sẹẹli NK ninu ẹgbẹ eewu giga.Ni awọn ọdun aipẹ, awọn inhibitors checkpoint inhibitors (ICIs) ti jẹ lilo pupọ ni itọju awọn èèmọ to lagbara.Sibẹsibẹ, lilo awọn ICI ni akàn pancreatic ti ṣọwọn ṣaṣeyọri.Nitorinaa, a ṣe ayẹwo ikosile ti awọn jiini ibi-iṣayẹwo ajẹsara ni awọn ẹgbẹ giga- ati kekere-ewu.A rii pe CTLA-4 ati CD161 (KLRB1) ti ni iwọn apọju ni ẹgbẹ eewu kekere (Nọmba 6B-G), ti o nfihan pe awọn alaisan PAAD ninu ẹgbẹ eewu kekere le jẹ ifarabalẹ si ICI.
Iṣiro ibamu ti awoṣe eewu asọtẹlẹ ati isọdi sẹẹli ajẹsara.(A) Ibaṣepọ laarin awoṣe eewu asọtẹlẹ ati infilt cell ajẹsara.(BG) Tọkasi ikosile jiini ni awọn ẹgbẹ eewu giga ati kekere.(HK) Awọn iye IC50 fun awọn oogun anticancer kan pato ni awọn ẹgbẹ eewu giga ati kekere.*p <0.05, **p <0.01, ns = ko ṣe pataki
A ṣe ayẹwo siwaju si ajọṣepọ laarin awọn ikun eewu ati awọn aṣoju chemotherapy ti o wọpọ ni ẹgbẹ TCGA-PAAD.A wa awọn oogun anticancer ti o wọpọ ni akàn pancreatic ati itupalẹ awọn iyatọ ninu awọn iye IC50 wọn laarin awọn ẹgbẹ giga ati eewu kekere.Awọn abajade fihan pe iye IC50 ti AZD.2281 (olaparib) jẹ ti o ga julọ ni ẹgbẹ ti o ni ewu ti o ga julọ, ti o fihan pe awọn alaisan PAAD ninu ẹgbẹ ti o ni ewu ti o ga julọ le jẹ sooro si itọju AZD.2281 (Figure 6H).Ni afikun, awọn iye IC50 ti paclitaxel, sorafenib, ati erlotinib wa ni isalẹ ninu ẹgbẹ eewu giga (Figure 6I-K).A tun ṣe idanimọ awọn oogun anticancer 34 pẹlu awọn iye IC50 ti o ga julọ ninu ẹgbẹ eewu giga ati awọn oogun anticancer 34 pẹlu awọn iye IC50 kekere ninu ẹgbẹ eewu giga (Table 2).
A ko le sẹ pe lncRNAs, mRNAs, ati awọn miRNAs wa jakejado ati ṣe ipa pataki ninu idagbasoke alakan.Ẹri pupọ wa ti n ṣe atilẹyin ipa pataki ti mRNA tabi miRNA ni asọtẹlẹ iwalaaye gbogbogbo ni awọn oriṣi alakan pupọ.Laisi iyemeji, ọpọlọpọ awọn awoṣe eewu asọtẹlẹ tun da lori awọn lncRNAs.Fun apẹẹrẹ, Luo et al.Awọn ijinlẹ ti fihan pe LINC01094 ṣe ipa pataki ninu ilọsiwaju PC ati metastasis, ati ikosile giga ti LINC01094 tọkasi iwalaaye talaka ti awọn alaisan alakan pancreatic [16].Iwadi ti a gbekalẹ nipasẹ Lin et al.Awọn ijinlẹ ti fihan pe idinku ti lncRNA FLVCR1-AS1 ni nkan ṣe pẹlu asọtẹlẹ ti ko dara ni awọn alaisan alakan pancreatic [17].Bibẹẹkọ, awọn lncRNA ti o ni ibatan ajesara ko ni ijiroro ni awọn ofin ti asọtẹlẹ iwalaaye gbogbogbo ti awọn alaisan alakan.Laipe, iye nla ti iṣẹ ti ni idojukọ lori kikọ awọn awoṣe eewu asọtẹlẹ lati ṣe asọtẹlẹ iwalaaye ti awọn alaisan alakan ati nitorinaa ṣatunṣe awọn ọna itọju [18, 19, 20].Imọye ti n dagba sii ti ipa pataki ti awọn infiltrates ajẹsara ni ibẹrẹ akàn, ilọsiwaju, ati idahun si awọn itọju bii kimoterapi.Ọpọlọpọ awọn ijinlẹ ti jẹrisi pe awọn sẹẹli ajẹsara ti nwọle ti tumọ ṣe ipa pataki ninu idahun si chemotherapy cytotoxic [21, 22, 23].Awọn microenvironment ajẹsara tumo jẹ ifosiwewe pataki ninu iwalaaye ti awọn alaisan tumo [24, 25].Imunotherapy, paapaa itọju ailera ICI, ni lilo pupọ ni itọju awọn èèmọ to lagbara [26].Awọn jiini ti o ni ibatan ajẹsara jẹ lilo pupọ lati kọ awọn awoṣe eewu asọtẹlẹ.Fun apẹẹrẹ, Su et al.Awoṣe eewu asọtẹlẹ ti o ni ibatan ajẹsara da lori awọn jiini ifaminsi amuaradagba lati ṣe asọtẹlẹ asọtẹlẹ ti awọn alaisan akàn ọjẹ-ọjẹ [27].Awọn Jiini ti kii ṣe ifaminsi gẹgẹbi awọn lncRNA tun dara fun ṣiṣe awọn awoṣe eewu asọtẹlẹ [28, 29, 30].Luo et al ṣe idanwo awọn lncRNA mẹrin ti o ni ibatan ajẹsara ati kọ awoṣe asọtẹlẹ kan fun eewu alakan cervical [31].Khan et al.Apapọ 32 ti a ṣe afihan awọn iwe afọwọkọ ti o yatọ ni a ṣe idanimọ, ati da lori eyi, awoṣe asọtẹlẹ kan pẹlu awọn iwe afọwọkọ pataki 5 ni a ti fi idi mulẹ, eyiti a dabaa bi ohun elo ti a ṣeduro pupọ fun asọtẹlẹ ijusile nla ti biopsy-fifihan lẹhin isọdọtun kidinrin [32].
Pupọ julọ awọn awoṣe wọnyi da lori awọn ipele ikosile pupọ, boya awọn jiini ifaminsi amuaradagba tabi awọn jiini ti kii ṣe ifaminsi.Bibẹẹkọ, jiini kanna le ni awọn iye ikosile oriṣiriṣi ni oriṣiriṣi awọn genomes, awọn ọna kika data ati ni awọn alaisan oriṣiriṣi, ti o yori si awọn iṣiro airotẹlẹ ni awọn awoṣe asọtẹlẹ.Ninu iwadi yii, a ṣe apẹrẹ ti o ni oye pẹlu awọn orisii lncRNA meji, ni ominira ti awọn iye ikosile gangan.
Ninu iwadi yii, a ṣe idanimọ irlncRNA fun igba akọkọ nipasẹ itupalẹ ibamu pẹlu awọn jiini ti o ni ibatan ajesara.A ṣe ayẹwo awọn 223 DEirlncRNAs nipasẹ isọdọkan pẹlu awọn lncRNA ti a fihan ni iyatọ.Ẹlẹẹkeji, a ṣe matrix 0-tabi-1 ti o da lori ọna sisọpọ DEirlncRNA ti a tẹjade [31].Lẹhinna a ṣe univariate ati awọn itupalẹ ipadasẹhin lasso lati ṣe idanimọ awọn orisii DEirlncRNA asọtẹlẹ ati kọ awoṣe eewu asọtẹlẹ kan.A ṣe itupalẹ siwaju ẹgbẹ laarin awọn ikun eewu ati awọn abuda ile-iwosan ni awọn alaisan pẹlu PAAD.A rii pe awoṣe eewu asọtẹlẹ wa, gẹgẹbi ifosiwewe asọtẹlẹ ominira ni awọn alaisan PAAD, le ṣe iyatọ awọn alaisan ti o ga ni imunadoko lati awọn alaisan kekere-kekere ati awọn alaisan ti o ga-giga lati awọn alaisan kekere.Ni afikun, awọn iye AUC ti iyipo ROC ti awoṣe eewu asọtẹlẹ jẹ 0.905 fun asọtẹlẹ ọdun 1, 0.942 fun asọtẹlẹ ọdun 2, ati 0.966 fun asọtẹlẹ ọdun 3.
Awọn oniwadi royin pe awọn alaisan ti o ni ifasilẹ sẹẹli CD8 + T ti o ga julọ jẹ ifarabalẹ si itọju ICI [33].Ilọsoke ninu akoonu ti awọn sẹẹli cytotoxic, awọn sẹẹli CD56 NK, awọn sẹẹli NK ati awọn sẹẹli CD8+ T ninu microenvironment ajẹsara tumo le jẹ ọkan ninu awọn idi fun ipa ipanilara tumo [34].Awọn ijinlẹ iṣaaju fihan pe awọn ipele ti o ga julọ ti tumo-infiltrating CD4 (+) T ati CD8 (+) T ni pataki ni nkan ṣe pẹlu iwalaaye to gun [35].Ti ko dara CD8 T cell infiltration, kekere neoantigen fifuye, ati ki o kan gíga immunosuppressive tumo microenvironment yori si aini ti esi si ICI ailera [36].A rii pe Dimegilio eewu ni ibamu ni odi pẹlu awọn sẹẹli CD8+ T ati awọn sẹẹli NK, ti o nfihan pe awọn alaisan ti o ni awọn iṣiro eewu giga le ma dara fun itọju ICI ati pe o ni asọtẹlẹ buruju.
CD161 jẹ ami ti awọn sẹẹli apaniyan (NK).CD8+CD161+ CAR-transduced T cell mediate mu dara si ni vivo antitumor ipa ni HER2+ pancreatic ductal adenocarcinoma xenograft awọn awoṣe [37].Awọn inhibitors checkpoint ajẹsara fojusi cytotoxic T lymphocyte ti o ni nkan ṣe amuaradagba 4 (CTLA-4) ati amuaradagba iku sẹẹli 1 (PD-1) / awọn ipa ọna iku sẹẹli 1 (PD-L1) ati ni agbara nla ni ọpọlọpọ awọn agbegbe.Ikosile ti CTLA-4 ati CD161 (KLRB1) wa ni isalẹ ni awọn ẹgbẹ ti o ni ewu ti o ga, ti o nfihan siwaju sii pe awọn alaisan ti o ni awọn ipele ti o ga julọ le ma ni ẹtọ fun itọju ICI.[38]
Lati wa awọn aṣayan itọju ti o yẹ fun awọn alaisan ti o ni ewu ti o ga julọ, a ṣe atupale orisirisi awọn oogun anticancer ati rii pe paclitaxel, sorafenib, ati erlotinib, eyiti a lo ni lilo pupọ ni awọn alaisan pẹlu PAAD, le dara fun awọn alaisan ti o ni eewu giga pẹlu PAAD.[33].Zhang et al rii pe awọn iyipada ni eyikeyi ipa ọna ibaje DNA (DDR) le ja si asọtẹlẹ ti ko dara ni awọn alaisan alakan pirositeti [39].Idanwo akàn Pancreatic Olaparib Ti nlọ lọwọ (POLO) fihan pe itọju itọju pẹlu olaparib gigun ilọsiwaju-ọfẹ iwalaaye ni akawe pẹlu pilasibo lẹhin kimoterapi ti o da lori laini akọkọ ni awọn alaisan ti o ni adenocarcinoma pancreatic pancreatic ati awọn iyipada BRCA1/2 germline [40].Eyi n pese ireti pataki pe awọn abajade itọju yoo ni ilọsiwaju ni pataki ni ẹgbẹ-ẹgbẹ ti awọn alaisan.Ninu iwadi yii, iye IC50 ti AZD.2281 (olaparib) jẹ ti o ga julọ ni ẹgbẹ ti o ni ewu ti o ga julọ, ti o fihan pe awọn alaisan PAAD ninu ẹgbẹ ti o ni ewu ti o ga julọ le jẹ sooro si itọju pẹlu AZD.2281.
Awọn awoṣe asọtẹlẹ ninu iwadi yii gbejade awọn abajade asọtẹlẹ to dara, ṣugbọn wọn da lori awọn asọtẹlẹ itupalẹ.Bii o ṣe le jẹrisi awọn abajade wọnyi pẹlu data ile-iwosan jẹ ibeere pataki.Endoscopic fine needle aspiration ultrasonography (EUS-FNA) ti di ọna ti ko ṣe pataki fun ṣiṣe iwadii aisan to lagbara ati awọn ọgbẹ pancreatic extrapancreatic pẹlu ifamọ ti 85% ati pato ti 98% [41].Ilọsiwaju ti awọn abẹrẹ biopsy ti o dara ti EUS (EUS-FNB) da lori awọn anfani ti a rii lori FNA, gẹgẹ bi deede iwadii aisan ti o ga, gbigba awọn ayẹwo ti o ṣe itọju eto itan-akọọlẹ, ati nitorinaa o ṣe ipilẹṣẹ àsopọ ajẹsara ti o ṣe pataki fun awọn iwadii kan.pataki abawọn [42].Atunyẹwo eto ti awọn iwe-iwe jẹri pe awọn abẹrẹ FNB (paapaa 22G) ṣe afihan ṣiṣe ti o ga julọ ni ikore àsopọ lati awọn ọpọ eniyan pancreatic [43].Ni ile-iwosan, nọmba kekere ti awọn alaisan ni o yẹ fun iṣẹ abẹ radical, ati pe ọpọlọpọ awọn alaisan ni awọn èèmọ ti ko ṣiṣẹ ni akoko iwadii akọkọ.Ni adaṣe ile-iwosan, ipin kekere ti awọn alaisan ni o dara fun iṣẹ abẹ radical nitori ọpọlọpọ awọn alaisan ni awọn èèmọ ti ko ṣiṣẹ ni akoko iwadii akọkọ.Lẹhin ijẹrisi pathological nipasẹ EUS-FNB ati awọn ọna miiran, itọju aiṣedeede ti kii ṣe iṣẹ-abẹ gẹgẹbi kimoterapi ni a yan nigbagbogbo.Eto iwadii atẹle wa ni lati ṣe idanwo awoṣe asọtẹlẹ ti iwadii yii ni iṣẹ-abẹ ati awọn ẹgbẹ alaiṣe iṣẹ-abẹ nipasẹ itupalẹ isọdọtun.
Lapapọ, iwadi wa ṣe agbekalẹ awoṣe eewu asọtẹlẹ tuntun ti o da lori isodipọ irlncRNA, eyiti o ṣe afihan iye asọtẹlẹ ti o ni ileri ninu awọn alaisan ti o ni akàn pancreatic.Awoṣe eewu asọtẹlẹ wa le ṣe iranlọwọ ṣe iyatọ awọn alaisan pẹlu PAAD ti o dara fun itọju iṣoogun.
Awọn akopọ data ti a lo ati itupalẹ ninu iwadi lọwọlọwọ wa lati ọdọ onkọwe ti o baamu lori ibeere ti o tọ.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Ipa ilaja ti ipa ti ara ẹni ni ilana ẹdun ti awọn ẹdun odi lakoko ajakaye-arun COVID-19: ikẹkọ apakan-agbelebu.Int J Ment Health nọọsi [irohin article].2021 06/01/2021;30 (3): 759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J, ati al.Awọn wiwo awọn ọmọ ẹgbẹ ẹbi lori ṣiṣe ipinnu yiyan ni awọn ẹka itọju aladanla: atunyẹwo eto.INT J NURS STUD [irohin article;atunwo].2023 01/01/2023;137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. akàn Pancreatic.Lancet.[Akosile irohin;atilẹyin iwadi, NIH, extramural;atilẹyin iwadi, ijoba ita awọn US;atunwo].Ọdun 2011 08/13/2011; 378 (9791): 607-20.
Ilic M, Ilic I. Arun akàn pancreatic.Iwe Iroyin Agbaye ti Gastroenterology.[Akosile irohin, awotẹlẹ].Ọdun 2016 11/28/2016;22 (44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. nomogram tuntun tp53 ti o ni ibatan fun asọtẹlẹ iwalaaye gbogbogbo ni awọn alaisan ti o ni akàn pancreatic.BMC Cancer [irohin article].2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Ipa ti itọju aifọwọyi ojutu-ojutu lori rirẹ ti o niiṣe pẹlu akàn ni awọn alaisan ti o ni awọ-awọ ti o ngba kimoterapi: idanwo iṣakoso ti a ti sọtọ.Akàn nọọsi.[Akosile irohin;Idanwo iṣakoso ti aileto;iwadi naa ni atilẹyin nipasẹ ijọba kan ni ita Ilu Amẹrika].2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y, ati al.Awọn ipele antigen carcinoembryonic (CEA) lẹhin isẹ-aṣesọtẹlẹ abajade lẹhin isọdọtun akàn ti awọ ni awọn alaisan pẹlu awọn ipele CEA iṣaaju iṣaaju.Ile-iṣẹ fun Iwadi Akàn Translational.[Akosile irohin].Ọdun 2020 01.01.2020; 9 (1): 111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X, et al.Awọn lncRNA ti o ni ibatan ajẹsara ṣe ipilẹṣẹ awọn ibuwọlu aramada ati asọtẹlẹ ala-ilẹ ajẹsara ti carcinoma hepatocellular eniyan.Mol Ther Nucleic acids [Akosile Akosile].Ọdun 2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Immunotherapy fun akàn pancreatic: awọn idena ati awọn aṣeyọri.Ann Onisegun inu ikun [Akosile Akosile;atunwo].Ọdun 2018 07/01/2018; 2 (4): 274-81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. Gigun awọn RNA ti kii ṣe ifaminsi (LncRNAs), awọn genomics tumor gbogun ti ati awọn iṣẹlẹ splicing aberrant: awọn ilolu itọju.AM J CANCER RES [akosile akọọlẹ;atunwo].2021 01/20/2021;11 (3): 866-83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Idamo ti awọn ibuwọlu lncRNA ti o ni nkan ṣe pẹlu asọtẹlẹ akàn endometrial.Awọn aṣeyọri ti imọ-jinlẹ [irohin akọọlẹ].2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S, et al.Itupalẹ okeerẹ ti awọn jiini isọtẹlẹ amuaradagba RNA ati awọn oludije oogun ni carcinoma sẹẹli kidirin sẹẹli papillary.pregen.[Akosile irohin].2021 01/20/2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, ati al.Awọn abuda ti autophagy-jẹmọ gigun ti kii ṣe ifaminsi RNA ṣe asọtẹlẹ asọtẹlẹ akàn igbaya.pregen.[Akosile irohin].2021 01/20/2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Ibuwọlu lncRNA mẹfa ti o niiṣe pẹlu ajesara ṣe ilọsiwaju asọtẹlẹ ni glioblastoma multiforme.MOL Neurobiology.[Akosile irohin].2018 01.05.2018; 55 (5): 3684-97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z, et al.Ibuwọlu tri-lncRNA aramada ṣe asọtẹlẹ iwalaaye ti awọn alaisan ti o ni akàn pancreatic.AWON asoju ONKOL.[Akosile irohin].2018 12/01/2018; 40 (6): 3427-37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 ṣe igbega ilọsiwaju ti akàn pancreatic nipasẹ ṣiṣe ilana ikosile LIN28B ati ipa ọna PI3K/AKT nipasẹ miR-577 onirinrin.Mol Therapeutics – Nucleic acids.Ọdun 2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, et al.Awọn esi to dara laarin lncRNA FLVCR1-AS1 ati KLF10 le ṣe idiwọ lilọsiwaju akàn pancreatic nipasẹ ọna PTEN/AKT.J EXP Clin akàn Res.2021;40 (1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Idanimọ ti awọn jiini mẹtala ti n sọ asọtẹlẹ iwalaaye gbogbogbo ni carcinoma hepatocellular.Biosci Rep [irohin article].2021 04/09/2021.
Akoko ifiweranṣẹ: Oṣu Kẹsan-22-2023